Z obsežno mrežo 3 pristanišča, Uganda Ponaša se z močno pomorsko infrastrukturo. Ključna vozlišča, kot so Fort Portal (UG), Kampala, Mbale so ključnega pomena pri obvladovanju velikega obsega trgovine, ponujajo različne logistične možnosti in zagotavljajo odporno povezljivost z mednarodnimi ladijskimi potmi po vsem svetu.