Z obsežno mrežo 3 pristanišča, Equatorial Guinea Ponaša se z močno pomorsko infrastrukturo. Ključna vozlišča, kot so Bata, malabo, Punta Europa Termina so ključnega pomena pri obvladovanju velikega obsega trgovine, ponujajo različne logistične možnosti in zagotavljajo odporno povezljivost z mednarodnimi ladijskimi potmi po vsem svetu.