Ar visaptverošu tīklu 4 ostas, Slovenia lepojas ar spēcīgu jūras infrastruktūru. Atslēgu centrmezgli, piemēram Izola, Koper, Ljublijana ir būtiska nozīme liela apjoma tirdzniecībā, piedāvājot dažādas loģistikas iespējas un nodrošinot elastīgu savienojamību ar starptautiskajām kuģniecības joslām visā pasaulē.