Ar visaptverošu tīklu 3 ostas, Puerto Rico lepojas ar spēcīgu jūras infrastruktūru. Atslēgu centrmezgli, piemēram PONCE, Puerto Nuevo (PR), San Juan ir būtiska nozīme liela apjoma tirdzniecībā, piedāvājot dažādas loģistikas iespējas un nodrošinot elastīgu savienojamību ar starptautiskajām kuģniecības joslām visā pasaulē.