Ar visaptverošu tīklu 165 ostas, Japan lepojas ar spēcīgu jūras infrastruktūru. Atslēgu centrmezgli, piemēram Abashiri, Aburatsu, Aioi ir būtiska nozīme liela apjoma tirdzniecībā, piedāvājot dažādas loģistikas iespējas un nodrošinot elastīgu savienojamību ar starptautiskajām kuģniecības joslām visā pasaulē.