Ar visaptverošu tīklu 5 ostas, Honduras lepojas ar spēcīgu jūras infrastruktūru. Atslēgu centrmezgli, piemēram La Ceiba, Puerto Castilla (HN), Puerto Cortes ir būtiska nozīme liela apjoma tirdzniecībā, piedāvājot dažādas loģistikas iespējas un nodrošinot elastīgu savienojamību ar starptautiskajām kuģniecības joslām visā pasaulē.