Ar visaptverošu tīklu 4 ostas, Czech Republic lepojas ar spēcīgu jūras infrastruktūru. Atslēgu centrmezgli, piemēram Brno, Olomouc, Prague ir būtiska nozīme liela apjoma tirdzniecībā, piedāvājot dažādas loģistikas iespējas un nodrošinot elastīgu savienojamību ar starptautiskajām kuģniecības joslām visā pasaulē.